SOMAmer 기반의 affinity proteomics 플랫폼으로, 단일 분석에서 약 11,000개 규모의 단백질을 동시에 측정할 수 있는 서비스입니다.
| 샘플 유형 | 권장 투입량 | 운반 방법 |
|---|---|---|
| Human plasma/serum | 총 130ul (실제 분석 입력량은 약 55 uL 수준이지만, QC 및 안정적인 운영을 위해 여유 분량 확보가 필요) | EDTA, citrate, CTAD, heparin 튜브 |
| Mouse plasma/serum | 프로젝트 목적에 따라 협의 후 진행 | 고객 서비스 문의 |
CSF, cell lysate, tissue homogenate, synovial fluid, exosome, lymphocyte, bone marrow aspirate, saliva, wound fluid 등도 프로젝트 조건에 따라 적용 가능함
샘플 전처리 및 보관
혈액은 채취 후 가능한 빠르게 전처리하고, 최종적으로는 채취 후 2시간 이내 -80 C 보관을 권장. Plasma는 채혈 후 30분 이내 처리하는 것이 바람직하며, serum은 실온에서 60-90분 응고 후 원심분리하고 원심분리 후 30분 이내 aliquot 분주. 반복적인 freeze-thaw는 피하며, 드라이아이스 상태로 운송 및 보관 필요.
접수 시 샘플 종류, 라벨링 상태, 제출량, 분주 상태, 보관 및 운송 상태를 확인하며, 혈청 및 혈장 샘플의 경우 용혈, 응고물, 침전 여부와 같은 분석 영향 요소를 함께 검토합니다.
품질 기준을 충족하지 못한 경우 고객에게 연락하여 가능한 처리 방안을 협의합니다.
수령 검수를 통과한 샘플은 분석 대기열에 배정되며, 프로젝트 설계에 맞는 처리 조건으로 다음 단계가 진행됩니다. 프로젝트 규모와 설계에 따라 plate layout, control, replicate 전략을 반영할 수 있으며, 코호트 연구나 비교 연구의 경우 샘플 간 편차를 줄일 수 있도록 전처리와 배치 구성을 함께 고려합니다
11K SomaScan은 SOMAmer(Slow Off-rate Modified Aptamer) 시약을 이용해 복합 생체시료 내 단백질에 선택적으로 결합한 뒤, 비특이적 결합을 줄이기 위한 경쟁 및 세척 과정을 거쳐 신호를 측정하는 방식의 분석 플랫폼입니다. 샘플은 여러 희석 조건에서 처리되어 넓은 농도 범위의 단백질을 안정적으로 포착할 수 있으며, 이를 통해 저농도 단백질과 고농도 단백질을 하나의 분석에서 함께 평가할 수 있습니다. 최종적으로 생성된 신호 데이터는 표준화 및 정규화 과정을 거쳐 단백질 abundance 데이터로 제공되며, 연구 목적에 따라 그룹 간 비교, 바이오마커 탐색, 환자군 분류, 후속 통계 분석 등에 활용할 수 있습니다.
분석 결과는 약 11,000개 규모의 단백질 measurement에 대한 상대 정량 기반 abundance 데이터로 제공됩니다. 일반적으로 정규화된 결과 테이블, 샘플 및 플레이트 QC 요약, 타깃 단백질 annotation 정보가 포함되며, 필요 시 후속 분석을 위한 기본 데이터 형태로 전달됩니다.
